Terug naar de hoofdpagina opdrachten
Opdrachten les 11
Source: https://en.wikipedia.org/wiki/Electrospray_ionization#/media/File:NanoESIFT.jpg
1.Gemiddelde molmassa van eiwit berekenen
Nadat een eiwit geïsoleerd is met antilichamen uit urine, is het geïnjecteerd op een LC-ESI-QQQ systeem.
Daarnaast is een globale molmassa van 8000 Da bepaald met gel electroforese en size-exclusion chromatografie gaf een molmassa van 8500 Da aan. De volgende massa’s zijn verkregen met de LC-MS: 631.9, 684.0, 745.5 en 819.7 m/z
a. Bereken de lading van de laagste drie m/z waarden
b. Bereken de gemiddelde molaire massa van dit eiwit in Da.
2.Peptide sequentie
Wat is de peptide sequentie van de volgende spectra.
In de onderstaande tabel staan de m/z waarden van de pieken in het spectrum
| # | m/z |
|---|---|
| Y(2) | 241.2 |
| Y(3)* | 341.2 |
| Y(3) | 355.2 |
| Y(7)++ | 377.7 |
| Y(4) | 454.3 |
| Y(5) | 553.4 |
| B(6) | 553.5 |
| B(7) | 667.5 |
| Y0(7) | 741.4 |
| Y(7) | 755.4 |
| Y0(8) | 838.5 |
| Y(8) | 852.5 |
3. Molmassa bepaling van een eiwit met MALDI
Met behulp van een MALDI ionisatie bron is een eiwit bestudeerd. Op het spectra ontstaan 2 pieken met de volgende m/z waarden: 27807 en 13904. Welke mogelijke ionisaties hebben plaatsgevonden?
4.Opgaven uit het boek
Maak de volgende opdrachten uit het boek:
Example 21.1 Example 21.2 Example 21.3 Example 21.4